Sellenberg và Bernadot lúc này cùng nhau điều khiển những hoạt động
liên quan đến việc đầu hàng của nước Đức. Sellenberg đã sẵn sàng cùng
Bernadot bay đến gặp Eisenhower. Ngoài ra hắn còn sắp xếp cuộc gặp gỡ
bí mật của Himmler với đại biểu Đại hội Do Thái toàn thế giới là Mazur,
hoàn toàn giấu kín không thông qua Hitler, kẻ lúc này thực sự không còn
điều hành đất nước.
Vào những ngày tồn tại cuối cùng của Đệ Tam Quốc xã, Sellenberg
chạy đi chạy lại giữa Himmler, Bernadot và đại diện của chính phủ Thụy
Điển, giữa Đan Mạch, Thụy Điển và Đức, tìm cách cứu vãn một cái gì đó.
Mà có lẽ trước hết là cứu chính bản thân mình.
Ngày 30 tháng 4 năm 1945, Kaltenbrunner đã tước bỏ tất cả mọi chức
vụ của Sellenberg.
Ngày 5 tháng 5 năm 1945, người đứng đầu chính phủ Đức thay Hitler là
đô đốc Denis đã chỉ định Sellenberg làm phái viên đến Stockholm.
Sellenberg đã tới nơi vào ngày 6 tháng 5 năm 1945. Đến đây cuộc đời chức
nghiệp của hắn kết thúc.
Sau sự sụp đổ của nước Đức, Sellenberg tìm được nơi nương náu bên
cạnh bá tước Bernadot. Tại đây Sellenberg lập tức lập báo cáo về các cuộc
đàm phán mà hắn có tham gia trong những tháng cuối cùng của cuộc chiến
tranh. Không lâu sau đó quân Đồng minh yêu cầu giao nộp Sellenberg.
Tháng 6 năm 1945, hắn trở về nước Đức để ra trình diện trước tòa án
Nuremberg.
Nhưng tại tòa án xét xử các tội phạm chiến tranh chủ yếu là Hering,
Ribbentrop và những tên khác (Himmler đã kịp tự sát) - Sellenberg chỉ phát
biểu với tư cách là nhân chứng. Phiên tòa dành riêng cho hắn bắt đầu năm
1947. Sellenberg được gỡ bỏ tất cả mọi cáo buộc, ngoại trừ hai tội: hắn là
thành viên SS và SD là hai tổ chức bị Tòa án Chiến tranh Thế giới ở
Nuremberg tuyên bố là những tổ chức tội phạm, còn Cục AMT-6 do hắn