Năm thứ 35 (1882) Hà thành thất lợi, Độ sung Phó khâm sai văn lĩnh Tuần
phủ Hà Nội, cùng với Chánh sứ Trần Đình Túc cùng đến Hà Nội hội
thương nhận thành trì làm việc. Bấy giờ quan Pháp muốn cho rút bỏ quân
đoàn Lưu, thường nhắc đến mãi. Thống đốc Hoàng Tá Viêm cho việc di
quân là việc khó, mà Hữu Độ vẫn cùng hắn (Lưu) đi lại thân thiện, xin giao
cho Hữu Độ khu xử. Hữu Độ thời bảo rằng Vĩnh Phúc đã ở lâu dưới quyền
Tá Viêm, xin giao cho Tá Viêm xử trí; hai người đều dâng sớ xin chỉ. Vua
bèn dụ Hữu Độ lại sung Tĩnh biên phó sứ, cùng với Tá Viêm hết lòng khéo
xử trí việc ấy. Tháng 11 đổi đi hộ Tổng đốc Hà Ninh. Độ dâng sớ xin từ
chối không được. Gặp khi xảy ra việc Cầu Giấy, quân Pháp phóng hoả đốt
thành, Hữu Độ bèn đi đến đóng ở huyện Từ Liêm. Sau được tin trong Kinh
cho biết thuyền binh Pháp đánh phá cửa Thuận, lại ký hòa nghị mới, Độ
tuân dụ về nơi cũ làm việc.
Bấy giờ Hữu Độ với quyền thần đương làm việc không hợp nhau. Vua Hàm
Nghi đã được lập nên, bèn bị bọn Ngự sử nêu hặc, có chỉ triệu Độ về Kinh,
nhưng Thống soái Pháp cố ý lưu giữ lại.
Hàm Nghi năm đầu (1885) bổ làm Thị lang quyền lĩnh Tổng đốc Hà Nội.
Tháng 5, Kinh thành hữu sự, tin báo đến, Độ cùng với các quan tỉnh đến
suý phủ Pháp giảng giải việc nước rồi theo suý phủ vào Kinh, cùng với Tôn
nhân đình thần tâu lên Thái hoàng thái hậu xin dựng Chính Mông đường
lên nối ngôi.
Mùa thu năm ấy Cảnh Tông (tức Đồng Khánh ) lên ngôi, gia phong cho Độ
làm Bảo quốc huân thần Thái sư Cần chính điện đại học sĩ Cơ mật đại thần,
Bắc kỳ Kinh lược đại sứ Vĩnh lại bá kiêm cố chư bộ nha sự vụ. Hữu Độ tùy
theo việc chỉnh đốn lại dần dần được đâu vào đó. Những hoàng thân, tôn
thất và quan lại trước bị quyền thần biếm truất, đều tâu xin xá, cho về.
Rước từ giá (tức Thái hoàng thái hậu ) ở Quảng Trị về, đến cư trú ở Khiêm
cung, Hữu Độ tâu xin rước về cung điện để chính ngôi mẫu tắc hậu đạo
hiếu trị.
