Hiện nay ô nhiễm môi trường đang đe doạ sự tồn tại của nhiều loài sinh vật,
trong đó có nhiều loài cá. GIS đã hỗ trợ tích cực trong công việc bảo tồn những
loài cá đang bị đe doạ. Các dữ liệu bao gồm thông tin về độ rộng và độ sâu của
dòng chảy, chất lượng và nhiệt độ nước, sự phân bố của các loài cá. Phần mềm
ARC/INFO đã được sử dụng để nhập dữ liệu vào một cơ sở dữ liệu gồm 250 lớp
thông tin bao phủ toàn bộ vùng châu thổ sông Columbia. Những thông tin này
đã được xuất bản trên CD-ROM và cung cấp cho các nhà quản lý tài nguyên.
Trường Ðại học Wisconsin đã sử dụng GIS để phân tích sự xâm thực trở lại của
loài sói lông xám ở miền đông cùng các yếu tố đưa đến sự tái thiết lập thành
công vùng phân bố này. Bản đồ cho thấy hướng di chuyển ổn định của loài sói
này đến miền đông.
Các đặc tính tự nhiên của các vùng sinh lý Maine có thể được đánh giá ngay lập
tức bằng việc sử dụng dữ liệu GIS để lập bản đồ. Văn phòng GIS vùng Maine
đã dùng GIS để phân chia 15 vùng tự nhiên của Maine cùng với các loài trong
mỗi vùng.
Kiểm soát các khu bảo tồn
