Chu Nguyên Chương tin lời, liền cho kiểm tra lại các phạm nhân bị
bắt. Lưu Cơ tra xét, quả có 1 số án oan. Ông tâu với Chu Nguyên Chương,
xin sửa những án oan đó, và thả những người bị oan ra. Cầu mưa và sửa án
oan vốn là 2 việc không liên quan gì đến nhau. Lưu Cơ cũng không có pháp
thuật gì để cầu mưa. Chẳng qua, ông hiểu thiên văn, có thể dự đoán được
sự thay đổi của thời tiết; liền mượn việc đó, khuyên Chu Nguyên Chương
sửa lại 1 số án oan mà thôi. Quả nhiên mấy hôm sau, mây đen đầy trời rồi
mưa như trút nước. Lưu Cơ nhân lúc Chu Nguyên Chương phấn khởi, liền
khuyên ông định ra pháp luật, lấy đó làm căn cứ, tránh việc giết nhầm
người vô tội. Sau khi Minh Thái Tổ lên ngôi, phong Lưu Cơ làm ngự sử
trung thừa, phụ trách công tác tư pháp. Lưu Cơ tiến hành công việc rất
nghiêm minh. Một lần, 1 người thân tín của thừa tướng Lý Thiên Trường
phạm pháp. Lý Thiên Trường là khai quốc công thần của triều Minh, lại là
đồng hương của Minh Thái Tổ, có thế lực rất lớn. Nhưng Lưu Cơ không
đếm xỉa gì đến sự ngăn trở của Lý Thiên Trường, cứ tâu lên Minh Thái Tổ,
cho xử chém kẻ phạm pháp đó. Việc này khiến Lý Thiên Trường thâm thù
ông. Vừa gặp dịp vào năm đó, kinh thành lại bị hạn hán, Minh Thái Tổ rất
lo lắng. Lưu Cơ nhân dịp đó tâu với Minh Thái Tổ: các chiến sĩ tử vong
trong chiến tranh, vợ con họ cần được chăm sóc; những thợ thuyền tử vong
trong khi xây đắp thành trì, xương cốt còn rải rác trên đồng ruộng, không ai
mai táng. Nếu giải quyết những việc đó, trời có thể mưa.
Minh Thái Tổ 1 lòng mong mưa, tất nhiên nhanh chóng thực hiện lời
khuyên của Lưu Cơ: cử người chăm sóc vợ con tử sĩ, chôn cất di cốt thợ
thuyền. Lưu Cơ tuy đã làm được mấy việc tốt trên, nhưng chỉ dựa vào ý
trời để khuyên vua, không phải lúc nào cũng trôi chảy. Lần này, điều dự
đoán của ông không ứng nghiệm, mọi việc đã tiến hành xong mà hơn 10
hôm sau, trời vẫn nóng như thiêu đốt, không có 1 giọt mưa nào. Điều này
làm Minh Thái Tổ tức giận, lại thêm lời gièm pha của Lý Thiên Trường,
khiến Lưu Cơ cảm thấy không yên. Lúc đó, bà vợ ông bị bệnh mất ở quê
nhà, Lưu Cơ liền nhân cớ đó xin nghỉ việc về nhà. Nhưng Minh Thái Tổ vẫ
đặc biệt coi trọng ông. Một lần, hoàng đế tỏ ý phong ông làm thừa tướng,
