một thùng tài liệu bí mật của Việt Cộng chôn giấu, liền báo tin cho cơ quan
mật vụ của Bác Sĩ Trần Kim Tuyến biết. ông Dương Văn Hiếu được cử ra
nghiên cứu thì thấy đây là một tài liệu ghi mật mã của Việt Cộng. ông
Dương Văn Hiếu liền cho làm bản sao và sau đó đem chôn lại chỗ cũ rồi
cho pháo binh bắn vào để phá các dấu vết đào bới. Nhờ vậy Việt Cộng
không nghi ngờ các khóa mật mã của họ đã bị khám phá. Dùng các khoá
mật mã bắt được, Đoàn Công Tác Đặc Biệt Miền Trung của ông Dương
Văn Hiếu đã giải mã hàng trăm văn kiện liên lạc giữa Việt Cộng và phát
hiện được hàng trăm cán bộ cao cấp nằm vùng của Việt Cộng từ Quảng Trị
đến Saigon. Trong các nhân viên cao cấp của Việt Cộng bị bắt, người ta
thấy có Cao Đăng Chiếm, Huỳnh Văn Trọng, Trần Ngọc Hiền, v.v. Sau khi
chế độ Ngô Đình Diệm bị lật đổ, các cán bộ cộng sản nằm vùng đã đưa
nhiều hồ sơ cho Thượng Tọa Thích Trí Quang và Võ Đình Cường, tố cáo
Đoàn Công Tác Đặc Biệt Miền Trung bắt giam người trái phép, trong đó có
vụ lớn nhất là vụ Nguyễn Văn Đạt ở Huế. Các lãnh tụ Phật Giáo chùa Từ
Đàm vẫn quả quyết Nguyễn Văn Đạt đã bị bắt oan, nhưng hồ sơ tình báo
cho thấy Nguyễn Văn Đạt là Bí Thư Tỉnh ủy Thừa Thiên của Việt Cộng.
Có nhiều các bộ hoạt động dưới quyền của Nguyễn Văn Đạt khi bị bắt cũng
đã xác nhận vậy. Nguyễn Văn Đạt Đạt đã làm tờ tự thú và xin trở về với
chính phủ Việt Nam Cộng Hòa. Về sau, bệnh sốt rét của Nguyễn Văn Đạt
tái phát nặng, cơ quan an ninh đã cho Nguyễn Văn Đạt trở về với gia đình
và giúp cho phương tiện cứu chữa.
Mặc dầu có nhiều tài liệu dẫn chứng các hồ sơ do các tăng sĩ chùa Từ Đàm
đưa ra tố cáo về việc bắt giam trái phép đều liên hệ đến các đặc công Cộng
Sản nằm vùng, ngày 25.6.1964, tòa đã tuyên án Dương Văn Hiếu, Nguyễn
Thiện Dzai, Nguyễn Tư Thái khổ sai chung thân và Phan Khanh 10 năm
khổ sai.
Hậu quả của bản án này là các nhân viên an ninh ở miền Trung không dám
bắt các cán bộ Việt Cộng nằm vùng hoạt động trong các tổ chức Phật Giáo
nữa, nên tình hình miền Trung rối loạn liên tục. Đây là chủ đích mà
Thượng Tọa Thích Trí Quang và Võ Đình Cường nhắm đạt tới.
Các nhân viên tình báo cao cấp nói rằng Thượng Tọa Thích Trí Quang