Denis Garibaldi Diderot và Baron Holbach đã ảnh hưởng sâu sắc đến ông.
Sau này, San Martin dấn thân vào cuộc đấu tranh giải phóng lật đổ ách
thống trị của thực dân. Sau ròng rã hai năm trời với biết bao công lao vất
vả, ông đã huấn luyện nên đội quân giải phóng Aldes, chủ yếu là do người
da đen và người lai hợp thành.
Đầu năm 1817, San Martin dẫn 5.000 quân viễn chinh vượt qua dãy núi
Aldes rồi bất ngờ đánh úp quân phòng thủ Tây Ban Nha tại Chile khiến cho
quân Tây Ban Nha tại Chile bị tiêu diệt hoàn toàn. Thắng lợi này có ý nghĩa
vô cùng quan trọng đối với phong trào giành độc lập ở Nam Mỹ, nó thúc
đẩy chiến tranh giải phóng Nam Mỹ từ phòng ngự chiến lược chuyển sang
tấn công chiến lược.
Tháng 2 năm 1818, Chile tuyên bố độc lập. Không lâu sau, San Martin
lại tập hợp lực lượng, lập ra một đội hải quân quy mô nhỏ rồi theo đường
biển tiến quân vào Peru. Peru khi ấy là mảnh đất thực dân vững chắc nhất
của Tây Ban Nha tại châu Mỹ.
Tháng 7 năm 1818, San Martin dẫn quân tiến đánh Lima, một tuần đã
giải phóng được Lima, Peru tuyên bố độc lập. Do lập được những chiến
công bất hủ trong phong trào đấu tranh giành độc lập ở Nam Mỹ nên San
Martin đã trở thành tổng tư lệnh quân đội miền Bắc Achentina.
Có thể nói là nếu như không có San Martin thì sẽ không có sự giải phóng
Nam Mỹ, cũng sẽ không có được độc lập và tự do của các nước cộng hòa
Nam Mỹ.
Nhưng đúng lúc mọi người hân hoan chào đón chiến thắng của San
Martin với một tấm lòng ngưỡng mộ và khâm phục vô hạn thì San Martin
đã chủ động rút khỏi chức vị tổng tư lệnh quân đội miền Bắc Achentina để
đến làm tỉnh trưởng của một tỉnh hẻo lánh là Guley. Tại đó ông đã tổ chức
huấn luyện tân binh và tiến quân vào Chile. Sau khi Chile được giải phóng,
chính phủ mới đã bổ nhiệm ông làm quan hành chính cao nhất, nhưng ông
đã từ chối để quay sang đảm nhiệm một trọng trách nặng nề nhất lúc bấy
giờ là tổ chức liên minh giữa quân đội Achentina và Chile để tấn công trận
