hắn tiếp tục làm việc ở cơ quan quản lí kinh tế. Hai ngày sau vụ mưu sát,
Canaris bị đích thân người kế nhiệm của mình là Sellenberg bắt.
Gestapo tiến hành cuộc điều tra hết sức kĩ lưỡng - bởi vì không đơn
giản khi xử tử hình một người nổi tiếng, bạn của tướng Franco, hơn nữa sự
tham gia của hắn vào vụ mưu loạn không có ai xác nhận. Sau đó chúng tìm
được một số chứng cớ riêng rẽ về các cuộc tiếp xúc với người Anh. Canaris
bị chuyển đến pháo đài Flossenburg, bị cùm chân suốt ngày đêm.
Ngày 9 tháng 4 năm 1945, đúng một tháng trước khi kết thúc chiến
tranh, Canaris bị xử tử cùng với năm tù nhân khác. Một đao phủ SS khai
trước tòa rằng Canaris bị treo cổ bằng một vòng thép và chết trong đau đớn
chỉ sau nửa giờ. Thi thể của các tù nhân bị thiêu trên đống lửa trong sân nhà
tù. Cũng có tin đồn rằng Canaris vẫn còn sống nhưng điều này bị phủ nhận.
Nhà nghiên cứu người Anh Cookridg viết về Canaris như sau: "Hắn ta
đã sát hại một cách tàn bạo hàng trăm con người, là một kẻ đầy âm mưu và
thủ đoạn"; còn Corte Riss, tác giả cuốn sách “Tình báo tổng hợp” gọi
Canaris là "kẻ giảo hoạt, quỷ quyệt, khéo xoay xở và là tên phiêu lưu vô
liêm sỉ". Và người ta còn nói rằng nếu hắn không bị Hitler treo cổ thì tòa án
Nuremberg cũng sẽ phải làm việc này.
