35 xe tăng Đức và 20 xe tăng Ý còn sức chiến đấu, và cả hai sư đoàn thiết
giáp Ý đã bị xáo trộn đáng kể. Với tình hình tiếp tế, sự thống trị của Lực
lượng Không quân Sa mạc, và ưu thế áp đảo về số lượng của Montgomery,
Rommel nhận ra rằng đã đến lúc phải rút lui nếu ông còn muốn cứu vãn đội
quân của mình. Vì vậy, ông bắt đầu rút các sư đoàn ở phần phía nam phòng
tuyến về vị trí đã chiếm được trước cuộc tấn công vào Alam Halfa. Ở phía
bắc, những thiết giáp còn lại và Sư đoàn Khinh binh 90 bắt đầu rút lui chậm
hơn để giúp lực lượng bộ binh thoát ra càng nhiều càng tốt. Các mệnh lệnh
ông ban ra khởi đầu với tuyên bố “Dưới áp lực cao độ của địch, quân đội
đang chuẩn bị rút lui dần từng bước, trong khi vẫn tiếp tục chiến đấu”. Vấn
đề bây giờ là biện hộ cho quyết định của Rommel sao cho phù hợp với ý
muốn của các cấp trên.
Trong một bức điện gửi đến OKW vào chiều ngày 2 tháng Mười một,
ông cảnh báo rằng Tập đoàn quân Thiết giáp châu Phi hiện đang không ở
trong tình trạng sẵn sàng để có thể ngăn ngừa một nỗ lực khác của người
Anh tại nơi phòng tuyến bị phá vỡ và “sự phá hủy dần dần quân đội do đó
phải được cho là không thể tránh khỏi, bất chấp sự chống cự anh dũng và
tinh thần gương mẫu của các binh sĩ”. Bức điện không hề đề cập đến bất kỳ
việc rút lui nào, và chính Tư lệnh Tối cao (Commando Supremo) tại Rome
có vẻ lần đầu tiên nghe nói về ý định rút lui của Rommel; nguồn tin là từ sĩ
quan liên lạc của Cavallero với Rommel. Phản ứng của Cavallero là rất tức
giận, vì ông dường như tin rằng Rommel đang có 250 xe tăng và được tiếp
tế đầy đủ. Vì thế, vào ngày 3 tháng Mười một, ông điện cho Rommel nói
rằng Mussolini cho là điều quan trọng là ông phải bám giữ các vị trí hiện
tại và đảm bảo với ông rằng nguồn tiếp tế bổ sung đang được gửi đến. Vào
thời điểm đó, Hitler đang ở Rastenburg tại Đông Phổ, thu mình trong Tổng
hành dinh Hang Sói mà ông ta sử dụng để chỉ đạo các hoạt động trên Mặt
trận phía Đông. Vào lúc 8:30 sáng, ông ta được báo rằng bản báo cáo tình
hình nửa đêm của Rommel bao gồm tuyên bố đã rút các sư đoàn bộ binh.
Tiếp theo là báo cáo buổi sáng, trong đó nói rằng việc rút lui đã diễn ra theo
đúng kế hoạch. Hitler tức giận đã soạn thảo một thông điệp gửi đến
Rommel, rằng cả nước Đức đang theo dõi và tin tưởng vào ông và quân đội
