Khi Nghị viện Anh đóng cửa hải cảng Boston vào tháng Sáu năm 1774,
Marblehead trở thành hải cảng chính trong việc nhập khẩu hàng hóa do
những người yêu nước trên các thuộc địa quyên góp ủng hộ những người
dân thành phố Boston, thì Gerry tham gia vào việc chuyên chở các hàng
hóa này.
Từ năm 1774 đến năm 1776, Gerry tham gia Đại hội các thuộc địa lần thứ
nhất và thứ hai. Ông cùng với Samuel Adams và John Hancock tham gia
Hội đồng An ninh và là Chủ tịch Ủy ban Hậu cần. Tại đây, ông cũng góp
phần tổ chức các đội quân và đảm nhiệm công việc hậu cần cho quân đội.
Tối ngày 18 tháng Tư năm 1775, Gerry tham gia một cuộc họp của Hội
đồng An ninh tại một quán trọ ở Menotomy (Arlington), giữa Cambridge và
Lexington, nên may mắn thoát khỏi đội quân Anh tuần tiễu ở Lexington và
Concord.
Năm 1776, Gerry tham gia Đại hội các thuộc địa, chuyên trách về các vấn
đề tài chính. Cho tới năm 1779, Gerry tham gia và đôi khi chủ tọa một hội
đồng của Đại hội các thuộc địa, để qui định các vấn đề tài chính cho liên
minh. Sau vụ tranh cãi về giá cho các nhu yếu phẩm mà bản thân là một nhà
cung cấp, nên Gerry đã rời khỏi Đại hội các thuộc địa. Dù là một thành viên
của cơ quan này, ông đã không đến dự trong suốt ba năm sau đó mà chỉ
tham gia hoạt động thương mại, là thành viên Hạ viện Massachusetts.
Là đại biểu Quốc hội Hợp bang trong những năm 1783-1785, Gerry thuộc
những người có khả năng khuấy động quần chúng trong cuộc Cách mạng và
là lãnh tụ của thời chiến, nhưng không có khả năng đương đầu có hiệu quả
với nhiệm vụ ổn định chính quyền quốc gia trong thời bình. Ông là người
có kinh nghiệm và cẩn thận, nhưng có nhiều kẻ thù do bản tính cứng nhắc,
và luôn nghi ngờ người khác có âm mưu xây dựng nền chuyên chế. Năm
1786, một năm sau khi rời Quốc hội, ông từ bỏ nghề kinh doanh, cưới bà
Ann Thompson và tham gia nghị viện tiểu bang.