Thứ nhất, bản chất táo bạo của hoạt động ngầm luôn có sức hấp dẫn đối với
Nhà Trắng. Tuy nhiên, mặc dù có xu hướng sử dụng hành động ngầm vì tin
rằng nó có thể giải quyết những vấn đề khó trong chính sách ngoại giao một
cách nhanh chóng, nhìn chung các tổng thống tỏ ra ít hiểu biết về khả năng
thực sự của hoạt động ngầm.
Thứ hai, các tổng thống lo ngại việc áp dụng các biện pháp bí mật vì sợ
những tác động chính trị tiềm ẩn sẽ xảy ra khi hoạt động ngầm bị phơi bày.
Sự lo ngại này dẫn đến thái độ thiếu quyết đoán về mức độ hoạt động ngầm
cần được thực hiện và việc giảm cường độ khi hoạt động ngầm không mang
lại kết quả như ý muốn.
Thứ ba, việc sử dụng hữu hiệu hành động ngầm với tư cách là một công cụ
của chính sách dường như vẫn là một thách thức khó vượt qua đối với Nhà
Trắng trong thời chiến tranh lạnh. Các đời tổng thống và cố vấn của họ
thường không có khả năng phối hợp và gắn kết hoạt động ngầm với năng
lực chiến tranh thông tin, quân sự, kinh tế và chính trị để cùng đạt tới mục
đích chính trị. Thường là hành động ngầm bị tách biệt khỏi những công cụ
trên của chính sách.
Thứ tư, tổ chức và điều hành các chương trình bí mật và phức tạp là rất khó
đối với Hoa Kỳ vì nó liên quan đến việc sử dụng đồng bộ nhiều chiến thuật
khác nhau: điệp viên, đánh lạc hướng, tâm lý chiến, phá hoại, hoạt động bán
quân sự... tập trung vào một mục đích chiến lược. Sự phối hợp các chiến
thuật được áp dụng trong các chương trình hoạt động ngầm lớn của thời
chiến tranh lạnh thường rất kém.
Thứ năm, khi có từ hai cơ quan trở lên cùng tham gia vào một hoạt động
ngầm, những khó khăn về quản lý và tổ chức tăng lên gấp bội. Tình trạng
này được đặc trưng bởi sự tranh chấp, thay vì hợp tác, giữa các cơ quan có
liên quan dẫn đến giảm hiệu quả hoạt động. Quá trình phối hợp càng rắc rối
hơn khi các cơ quan Hoa Kỳ phải thiết lập quan hệ liên lạc và làm việc với
chính phủ hoặc nhóm người nước ngoài để thực hiện hoạt động ngầm.
