nơi Talmud của phương Tây được hoàn thành vào thời Thánh Jerome (342-
420) lập ra giới tu sĩ của riêng mình ở Jerusalem, là bằng chứng cho sự
nghèo đói và khốn khổ của người Do Thái. Chẳng bao lâu sau khi ông qua
đời, một nhóm tu sĩ Syria dưới sự dẫn dắt của Barsauma cuồng tín đã tiến
hành một loạt các cuộc tàn sát ở Palestine Do Thái, đốt cháy các giáo
đường và toàn bộ làng mạc. Trong Kỷ nguyên đen tối, Palestine quả thực
ngày càng nghèo và dân số ngày càng giảm do xung đột tôn giáo. Thuyết
Pelagius,
và sau này là các tranh cãi về giáo lý độc thể khiến
người Kitô bị chia rẽ. Khuynh hướng này ngược đãi điên cuồng khuynh
hướng kia khi nó nắm giữ quyền lực nhà nước. Vào thế kỷ 4, người
Samaria hồi sinh: ít nhất tám giáo đường mới được xây trong giai đoạn này.
Nhưng sự gia tăng số lượng giáo đường thu hút sự chú ý thù địch của giới
chức Byzantine. Năm 438, Hoàng đế Theodosius II áp dụng quy chế bài Do
Thái đối với các giáo đường này. Khoảng 45 năm sau, họ nổi dậy, tàn sát
các cộng đồng Do Thái và đốt cháy nhà thờ. Quân đội Byzantine đã dập tắt
cuộc nổi dậy, và trong quá trình bị đàn áp họ mất điện thờ cổ của mình trên
núi Gerizim, sau này trở thành nhà thờ Đức Mẹ đồng trinh. Dưới thời
Hoàng đế Justinian (527-565), một người cai trị còn chính thống hơn, chỉ
cho phép những ai có tư cách công dân mới được rửa tội, và săn lùng cả
người Kitô nếu họ không tuân theo quyết định của Hội đồng Chalcedon
giống như mọi người khác, người Samaria lại nổi dậy. Sự báo thù sau đó
tàn bạo đến mức họ gần như bị tiêu diệt trên tư cách một quốc gia và một
đức tin. Người Do Thái lúc này nằm im chờ thời và chắc chắn không giúp
đỡ người Samaria. Nhưng vào nửa đầu thế kỷ 7, Hoàng đế Phocas và
Hoàng đế Heradius, dưới sức ép của các tu sĩ cuồng tín từng cảnh báo rằng
đế chế của họ sẽ bị người đã cắt bao quy đầu hủy diệt, bèn cố gắng áp đặt lễ
rửa tội lên người Do Thái bằng vũ lực.
Đế chế Byzantine, bị suy yếu bởi vô số các cuộc tranh chấp tôn giáo, đã
mời gọi sự xâm lược. Cuộc xâm lược đầu tiên xảy ra năm 611 khi người Ba
Tư tiến vào Palestine, chiếm Jerusalem trong ba năm sau một cuộc vây hãm
kéo dài 20 ngày. Người Do Thái bị buộc tội đã hỗ trợ họ. Theo người Kitô,
