Sau 47 năm ở trên ngai vàng làm vì, vua Hiển Tông mới được hưởng vài
ngày thoát khỏi ách chúa Trịnh thì đã băng hà. Trước đó, triều đình đã chọn
Lê Duy Khiêm - cháu đích tôn của vua lên nối ngôi. Những lúc trò chuyện
cùng vợ, Nguyễn Huệ vẫn hay hỏi về những người trong hoàng tộc, xem ai
là người có tài xứng đáng làm vua. Ngọc Hân thực tình cho biết, Duy Khiêm
là con người tầm thường, chỉ có anh mình là Sùng Nhượng công Duy Cẩn
xứng đáng hơn cả. Vì thế Nguyễn Huệ có ý không muốn lập Duy Khiêm
làm vua. Hoàng gia vô cùng lo lắng, lại cho Ngọc Hân làm rối kỉ cương, có
người còn đòi xóa bỏ tên nàng khỏi hoàng tộc. Ngọc Hân sợ hãi, vội xin
Nguyễn Huệ đồng ý cho Duy Khiêm lên làm vua, tức Lê Chiêu Thống.
Vì chuyện này, Nguyễn Huệ rất tức giận, ông muốn kéo quân về Nam
ngay, để mặc cho triều đình nhà Lê khu xử. Song nể lời Ngọc Hân, ông nán
ở lại. Ông mặc áo tang đứng bên tả điện xem xét mọi việc tế lễ rất nghiêm
cẩn. Ngày tống táng, Nguyễn Huệ cưỡi voi đi đầu ba ngàn quân sĩ đưa quan
tài đến tận nơi chôn cất. Sau lễ tang, ông nói với Ngọc Hân:
