Chiến lược và thể chế chinh phục hoàn tất ở Mexico nhanh chóng
được áp dụng cho những nơi khác dưới thời đế quốc Tây Ban Nha. Không
nơi nào các chiến lược và thể chế này được thực hiện hữu hiệu bằng cuộc
chinh phục Peru của Pizarro. Như de las Casas bắt đầu trong tài liệu của
ông:
Năm 1531, lại một kẻ đại gian ác khác cùng đoàn tùy tùng đến thám
hiểm vương quốc Peru. Hắn bắt đầu với dự định bắt chước chiến lược và
chiến thuật mà những nhà thám hiểm đồng liêu đã thực hiện tại những nơi
khác ở Tân thế giới.
Pizarro bắt đầu trên bờ biển gần thành phố Peruvian của người
Tumbes và tiến về phía nam. Ngày 15/11/1532, ông đến thành phố núi
Cajamarca, nơi vua Inca Atahualpa cắm trại cùng các binh lính. Ngày hôm
sau, Atahualpa, người vừa đánh bại em trai mình là Huáscar trong cuộc
tranh tài giành quyền kế vị vua Huayna Capac mới băng hà, đi cùng đoàn
tùy tùng đến nơi người Tây Ban Nha cắm trại. Atahualpa bị kích động vì
tin tức về những hành động hung bạo mà người Tây Ban Nha gây ra, như
vụ xâm phạm một ngôi đền Thần Mặt trời Inti. Những gì xảy ra sau đó ai
cũng biết. Người Tây Ban Nha giăng bẫy và giật bẫy. Họ giết binh lính bảo
vệ và tùy tùng của Atahualpa, có lẽ lên đến hai nghìn người, và bắt giữ nhà
vua. Để được tự do, Atahualpa phải cam kết cống nạp một gian phòng chất
đầy vàng và hai gian phòng như thế chất đầy bạc. Ông đã làm điều đó
nhưng người Tây Ban Nha bội ước và siết cổ ông cho đến chết vào tháng
7/1533. Tháng 11 năm đó, người Tây Ban Nha thâu tóm thủ đô Cusco của
người Inca, và giới quý tộc Inca ở đây bị đối xử hệt như Atahualpa, bị cầm
tù cho đến khi họ cống nạp vàng bạc. Khi không thỏa mãn những đòi hỏi
của người Tây Ban Nha, họ bị thiêu sống. Các kho báu nghệ thuật vĩ đại
của Cusco, như đền thờ Thần Mặt trời, bị bóc gỡ vàng và nấu chảy thành
vàng thỏi.