Phạm Ngọc Thảo đã mở được nhiều khóa huấn luyện cán bộ tình báo
cho các tỉnh, lập nên một hệ thống tình báo của các tỉnh phía Nam, sau này
đã giúp việc đắc lực cho các quân khu nắm tình hình địch và làm công tác
địch vận rất có kết quả.
Khi tướng Nguyễn Bình được cử làm Tư lệnh Nam Bộ, Ban quân sự
Xứ ủy Nam Bộ giải thể và phân bố lại các Quân khu 7, Quân khu 8, Quân
khu 9, Phạm Ngọc Thảo được phân công về Quân khu 9, là Tiểu đoàn
trưởng Tiểu đoàn 410.
Đại tá Tăng Thiện Kim, nguyên Chính trị viên phó kiêm Phó bí thư
Tiểu đoàn 410, người đã kết nạp Phạm Ngọc Thảo vào Đảng, tại Rạch Bà
Đăng, Thới Bình, rất quý mến Phạm Ngọc Thảo, cho biết, Phạm Ngọc
Thảo là người rất ham học các kỹ thuật chiến thuật trong chiến đấu cũng
như các vấn đề chiến lược của cuộc kháng chiến. Anh còn ham mày mò,
chế tạo ra chiếc cò nẩy cho súng cối. Có cái cò này, súng cối bắn chính xác
hơn trước nhiều. Khi có lệnh cho đơn vị học tập cách đánh đặc công, Phạm
Ngọc Thảo đã cùng trinh sát bò vào đồn địch ban đêm để nghiên cứu cách
bố phòng của địch và về đơn vị làm sa bàn, trình bày kế hoạch tiến công.
Anh đã tham gia nhiều trận đánh, từ những trận đánh tiểu đoàn độc lập tới
những trận đánh phối hợp trong chiến dịch. Nhiều trận đã đem lại thắng lợi
to lớn...
Vào giữa năm 1953, Phạm Ngọc Thảo được cấp trên triệu tập đi học
lớp huấn luyện trung cao của Xứ ủy Nam Bộ. Lớp học bế mạc sau Chiến
thắng Điện Biên Phủ và Hội nghị Giơnevơ về Việt Nam. Phạm Ngọc Thảo
đã được gọi ra Việt Bắc và đích thân đồng chí Lê Duẩn trao nhiệm vụ vào
hoạt động ngay trong lòng địch. Nghĩa là Phạm Ngọc Thảo cần tìm mọi
cách chui được vào chính quyền ngụy, cố gắng lọt được vào gia đình Ngô
Đình Diệm... Anh có lợi thế là gia đình Thiên Chúa giáo lâu đời, thân thiết
với linh mục Ngô Đình Thục đã từng cai quản giáo xứ Vĩnh Long là quê
quán của Phạm Ngọc Thảo. Chính linh mục Ngô Đình Thục đã làm lễ rửa
