Để có thêm lúa gạo phục vụ chiến tranh, Nguyễn Ánh cho đặt thêm thuế
phụ ngoài thuế ruộng một năm hai kỳ thu là thuế thị túc và thuế thị nạp.
Đến trước đây hai năm, Nguyễn Ánh cũng bắt đầu cho đưa các nhóm
thợ thủ công ông đưa từ miền Trung Đại Việt vào. Ông cho quy hoạch lại
nghề thủ công ở vùng Gia Định: ông cho quy hoạch ra sáu mươi bốn ty thủ
công gồm đủ các loại ngành nghề được phân bố khắp các dinh. Khu vực
Sài Gòn có sở Nhà Đồ gồm hai mươi hai ty, trong đó có các ty thợ mộc, thợ
sơn, thợ cưa. Bên cạnh đó còn có các đội chuyên trách phục vụ cho các ty
và tổ chức gọi là "nậu" gồm dân thợ cùng nghề ở các vùng dân cư hẻo lánh,
chưa nên thôn xóm.
Việc mua bán với nước ngoài cũng được khuyến khích và kiểm soát
chặt chẽ, nhất là đối với các mặt hàng có liên quan tới quân sự như kẽm,
sắt, đồ đồng, diêm, lưu huỳnh, sắt, gang, chì đen để có thêm nguồn tài
chính và binh khí.
Từ trước khi Nguyễn Phúc Cảnh về, Nguyễn Ánh đã đưa ra chính sách
mời gọi thuyền nhà Thanh vào buôn bán. Ngoài ra, Ánh còn thường xuyên
cho thuộc cấp đi qua các khu vực do thực dân phương Tây kiểm soát gần
Đại Việt để mua binh khí, trong đó quân Nguyễn thường xuyên lui tới nhất
là các khu vực lãnh thổ phía Tây như Batavia, Malacca, Transquebar.
Để kiểm soát Gia Định, người Khmer vốn là dân bản địa, Ánh phải cho
hai tướng người Khmer của mình về coi các vùng có số dân Khmer đông để
thiết lập các khu vực tự trị, đề ra các chính sách và luật lệ hạn chế xung
khắc với người Việt, việc tương tự cũng diễn ra ở khu vực Hà Tiên.
Đối với cộng đồng người Hoa, ông đưa ra chính sách đối xử với họ
cũng giống như người Việt: cũng phải nộp thuế, đi lính; và lập chức Tổng
phủ người Hoa cai quản hai vùng phức tạp Ba Thắc và Trà Vinh. Bên cạnh
đó, ông cũng cho kiểm tra dân số để tiện việc bắt lính và thu thuế, đưa ra
các chính sách chống trộm cướp và gìn giữ an ninh; các hình thức tệ nạn
