Nếu ta thêm vào hai phân tử amino acid nữa thì sẽ có bốn phân tử amino
acid nối với nhau thông qua liên kết amide.
Với bốn amino acid, ta có bốn nhóm biên, được biểu diễn trong hình trên
là R, R’, R’’, R’’’. Các nhóm biên này có thể hoàn toàn giống nhau, hoặc
khác một phần, hoặc khác hoàn toàn. Dù chỉ có bốn amino acid trong
chuỗi, nhưng có rất nhiều cách kết hợp khả dĩ. R có thể là bất kỳ phân tử
nào trong 22 amino acid, R’ cũng có thể là phân tử bất kỳ trong 22 amino
acid, và tương tự đối với R’’ và R’’’. Điều này có nghĩa là số khả năng kết
hợp là 22⁴ hay 234.256 khả năng. Ngay cả một phân tử protein tương đối
nhỏ là insulin, hormone tiết ra bởi tuyến tụy có nhiệm vụ điều khiển quá
trình chuyển hóa glucose trong cơ thể, được cấu thành bởi 51 amino acid,
như vậy số khả năng kết hợp các amino acid trong insulin là 22⁵¹ (2,9 x
10⁶⁸), hay là hàng tỷ tỷ cách.
Ước tính khoảng 80-85% các amino acid của lụa là một chuỗi lặp đi lặp
lại theo thứ tự xác định của glycine-serine-glycine-alanine-glycine-alanine.
Chuỗi polymer protein của lụa có sự sắp xếp theo dạng zig zag, với các
nhóm biên tuần tự thay đổi về mỗi phía của mạch chính như sau:
