9.1862, Bonard đích thân sang thăm vua Norodom (Nặc Ông Chân), yêu
cầu nhà vua nhận cho Pháp bảo hộ. Nhà vua còn trù trừ thì năm sau,
Lagrandière sợ nếu để trì hoãn lâu thì Thái lan sẽ nhảy vào tranh giành ảnh
hưởng nên đã đích thân lên Phnom Penh gặp Norodom, ép nhà vua ký hiệp
ước bảo hộ vào tháng 7-1863.
Mới đầu, người Pháp chiếm sáu tỉnh Nam Kỳ và Campuchia với mục đích
tìm đường đi đến Nam Trung hoa. Một phái đoàn thám hiểm ngược dòng
sông Cửu Long được thành lập, do De Lagrée làm trưởng phái đoàn,
Francis Garnier phụ tá. De Lagrée bị chết trong chuyến thám hiểm, còn
Garnier đến được Vân Nam. Phái đoàn nhận thấy không thể dùng tàu bè
ngược sông Cửu Long để lên Vân Nam, nhưng tại Vân Nam, Garnier gặp
Jean Dupuis (Đồ Phổ Nghĩa), một thương gia, Jean Dupuis xúi Garnier yêu
cầu Thống Đốc Nam Kỳ Duprée can thiệp để Dupuis có thể dùng sông
Hồng Hà để sang Vân Nam buôn bán. Garnier được cử đem quân ra Hà nội
dàn xếp, và sau mấy ngày thương thuyết không xong, Garnier tấn công và
lấy được thành Hà nội. Tổng đốc Hoàng Diệu tự tử, Garnier sau đó cũng bị
quân Cờ Đen phục kích giết chết.
Thấy không sử dụng được sông Cửu Long, người Pháp tìm cách khai thác
những mối lợi khác. Năm 1884, họ đòi vua Norodom phải ký thoả ước để
người Pháp được nắm toàn quyền về hành chánh, tư pháp, tài chánh,
thương mại và thu tất cả mọi thứ thuế. Vua Norodom từ chối, Lagrandière
tự đem tàu chiến lên Phnom Penh, vào tận hoàng cung, ép vua Norodom
phải ký.
Tự ái dân tộc bị tổn thương, nhân dân Campuchia nổi loạn dưới sự lãnh đạo
của hoàng thân Si Vatha. Người Pháp phải đánh dẹp hai năm mới yên. Vua
Norodom chết năm 1904, em của ông là Sisowath nối ngôi, trị vì đến năm
1927 thì con là Monivong nối nghiệp. Nhưng khi Monivong mất năm 1941
thì toàn quyền Decoux lại chọn Sihanouk là chắt của vua Norodom lên ngôi
