Đối với người Palestine, việc mở đường hầm này có nghĩa là người
Israel đang "đụng vào" các nơi thánh của họ và thay đổi tình trạng hiện hữu
của Jerusalem. Các vụ bạo động tiếp theo đã vĩnh viễn thay đổi các quy luật
của Intitada. Thay vì chỉ có các cuộc bạo động ném đá như trước kia, bây
giờ các lực lượng an ninh Palestine cũng nhập cuộc. Hơn 70 người Israel và
Palestine đã bị giết trong thời kỳ đầu này của phong trào Al-Aqsa Intifada.
Nếu người Palestine đứng lên quá nhanh để bảo vệ Al-Aqsa Intifada,
đó không phải chỉ vì nhiệt tình tôn giáo. Họ còn có lý do chính đáng để
nghi ngờ các ý đồ của Israel. Năm 1984, các lực lượng an ninh Israel đã
khám phá một âm mưu của một nhóm dân định cư Do Thái, gọi là nhóm Do
Thái Bí mật, muốn phá nổ các đền thờ Hồi giáo trên Núi Thánh. Năm trước,
một nhóm chúng sinh Do Thái bị bắt đang khi chuẩn bị đào một chỗ dưới
núi để cử hành lễ Vượt qua gần khu phế tích của đền thờ. Có lời đồn rằng
họ có kế hoạch thiết lập một khu "định cư" dưới hầm và thương lượng để
được quyền cầu nguyện trên Núi Thánh.
Năm 1969, một du khách quá khích người Úc theo Kito giáo đã đốt
đền thờ Al-Qawa và phá hủy giảng đài bằng gỗ nổi tiếng do đại giáo chủ
Saladin tặng. Năm 1982 một người Do Thái ngông cuồng đã bắn vào một
vệ binh Hồi giáo tại Đền Thờ Vòm Đá. Các sự cố như thế xảy ra rất nhiều.
Tất cả những sự cố này có thể không phải trực tiếp do chính quyền
Israel chỉ đạo, nhưng người Palestine không thể tin tưởng chính quyền
Israel. Trong những ngày sau khi chiếm cổ Thành, các xe ủi đất của Israel
đã dọn sạch hơn 100 gia đình người A Rập khỏi khu vực Mughrabi phía
trước mặt Bức tường phía Tây để làm một sân cầu nguyện cho người Do
Thái. Bất chấp lời cam kết của Dayan là duy trì các nơi thánh, hai đền thờ
Hồi giáo đã bị phá hủy.
Các nơi thánh khác của Hồi giáo tại Bờ Tây đã dần dần bị người Do
Thái chiếm. Mộ của tổ phụ Abraham ở Hebron, của tể phụ Giuse ở Nablus
