Các giám mục cũng bàn thảo xem các văn bản nào được Thiên Chúa
linh ứng cho toàn thể Giáo Hội. Một số người, tỉ như Marcion, đã từ chối
tính cách linh ứng của Kinh Thánh Do Thái (Cựu Ước) và chỉ chấp nhận
một số văn bản giới hạn. Các tổ chức khác, tỉ như Gnostic (Tri thức giáo)
lại coi một số văn bản rất khác thường là do Thiên Chúa linh ứng. Thí dụ,
một phúc âm của phái Gnostic đưa ra hình ảnh Ðức Giêsu khi còn nhỏ đã
biến con chim bồ câu đất trở nên sống thực, và gây nên cái chết của những
trẻ cùng lứa vì chúng chọc tức Ðức Giêsu. Ðể đối phó với vấn đề này, các
giám mục đưa ra một danh sách các văn bản chính thức mà các người tin là
Thiên Chúa linh ứng, được gọi là quy điển (canon), mà sau này được dùng
làm nền tảng cho bộ Kinh Thánh của chúng ta ngày nay. Tuy nhiên, mãi
đến thế kỷ thứ tư, bộ quy điển Tân Ước vẫn chưa được hoàn tất. Ðiều này
cho thấy sự quan trọng của Chúa Thánh Thần trong việc dẫn dắt các giám
mục nhằm tỏ lộ chân lý của Thiên Chúa một cách trọn vẹn.
Các giám mục của thế kỷ thứ hai còn phải đương đầu với các lạc
thuyết, tỉ như sự tin tưởng rằng Thiên Chúa chỉ có một ngôi, và hậu quả là
Ðức Giêsu Kitô chỉ là một con người; hoặc sự tin tưởng ngược lại là Kitô
Hữu thờ ba chúa chứ không phải một. Phe Gnostic cho rằng bề ngoài Ðức
Giêsu là một con người, nhưng thực sự Người là một thần thánh (thuyết
Docetism). Tất cả những tin tưởng này đều bị các giám mục lên án là sai
lạc.
Các giám mục còn sửa sai các tổ chức tách rời khỏi Giáo Hội vì các lý
do khác. Phe Montano, là những người tin theo một linh mục tên
Montanus, họ cho rằng Ðức Giêsu sẽ tái giáng lâm ngay vào thời ấy. Họ
muốn ép buộc mọi Kitô Hữu phải sống khắc khổ; họ còn cho rằng các điều
họ được mặc khải có giá trị ngang bằng với các thư của Thánh Phaolô cũng
như bốn Phúc Âm. Khi các giám mục Công Giáo không đồng ý với các
điều này, phe Montanô khởi sự thành lập một giáo hội riêng và lôi cuốn
được cả vị bảo vệ đức tin của Giáo Hội ở Bắc Phi, là Tertullian. Phe
Montanô tan rã ngay sau khi Tertullian từ trần vào năm 220.
Nhiều giáo thuyết lầm lạc và các tổ chức lẻ tẻ xuất hiện trong thế kỷ
này, nhưng chỉ có giáo hội hoàn vũ được hướng dẫn bởi giám mục đoàn là
