Nhìn chung, khí hậu Côn Đảo trong lành, thuận lợi cho sức khỏe con
người. Nhưng điều này còn tùy thuộc rất nhiều ở vị trí cụ thể, nơi ở cao hay
thấp, có chướng ngại che chắn gió nhiều hay ít. Nước ngầm là nguồn nước
ngọt chủ yếu ở đảo để dùng trong sinh hoạt cũng như trong mọi hoạt động
kinh tế.
Côn Đảo còn là một bảo tàng thiên nhiên lớn với Rừng Quốc gia Côn
Đảo. Rừng có diện tích 6.043 hecta (chiếm 83,7% tổng diện tích tự nhiên
của huyện đảo.
Rừng gồm 3 hệ sinh thái chủ yếu:
– Rừng nhiệt đới thường xanh quanh năm.
– Rừng đồi cát khô .
– Rừng đước và rừng sau đước.
Những khảo sát sơ bộ cho thấy ở đây có 650 loại - thực vật thuộc về 22
lớp, 71 họ; đại diện cho các vùng khí hậu Việt Nam (cả Bắc, Trung, Nam),
trong đó có 26 loại cây lấy gỗ với nhiều loại gỗ quý như: cẩm lai, quăng,
sao, giáng hương. . . và 76 loại cây dược liệu. Trong rừng có 100 loại chim
và thú lưỡng cư thuộc 50 họ và 22 lớp; 18 loại động vật có vú; 65 loại
chim; 25 loại bò sát; 6 loại ếch và 150 loại động vật thân mềm. Động vật
quí hiếm có sóc đen, sóc da đỏ, sóc bay, khỉ vàng, gầm ghi trắng, đại bàng
biển, trăn... Hòn Trứng là nơi cơ trú của các loại chim biển, mật độ dày đặc,
có thể so sánh với những sân chim nổi tiếng ở miền Tây Nam Bộ . Đặc biệt
ở đây có chim Điêu lặt xanh, ó biển là những loại chim hiếm trên thế giới.
Trong lòng biển có những bãi hải sâm lớn, nơi cư ngụ của cá heo. Tại
những bãi biển của Hòn Bảy Cạnh, Hòn Tre Lớn là nơi sinh đẻ của vích và
đồi mồi. Nhiều hang và vách đá của Hòn Cau, Hòn Tre Nhỏ , vịnh Đầm Tre
. . . là nơi cơ ngụ của chim yến.
Ngoài khí hậu nhiệt đới gió mùa, chịu ảnh hưởng sâu sắc của biển, ở các
vùng núi của Côn Đảo có khí hậu mát mẻ như cao nguyên Đà Lạt, Rừng
Quốc gia Côn Đảo là bức tranh thu nhỏ của thảm thực vật rừng Việt Nam.
Cũng ở đây nhiều di tích khảo cổ học giá trị được phát hiện, hé mở một