Tự) độc lập với Shôkokuji. Năm 1908, Kôgakuji (Hướng Nhạc Tự) lại
hoàn toàn tách ra khỏi Nanzenji sau khi đã nhận được phép (công hứa)
từ năm 1890. Hiện nay thì con số chi phái tông Lâm Tế đã lên đến 14
phái. Các phân phái đẻ ra sau này thường là chùa địa phương, xa
những trung tâm Phật giáo truyền thống như Kyôtô và Kamakura.
*Giáo đoàn được cận đại hóa
Như đã nói, các tông phái Thiền Tông đều đặt chức kanchô (quản
trưởng) để dại diện tông mình. Từ năm 1884, khi vai trò của
kyôdôshoku (giáo đạo chức) bị phế bỏ thì các kanchô được ủy thác
việc trông coi chế độ chư tông và pháp luật tự viện, phân chia chức vụ
và danh hiệu tăng ni, phong chức và bãi chức trụ trì, chọn lựa những
nhà truyền giáo và qui định những nguyên tắc về việc quản lý tài sản
các chùa. Nhờ vậy mà cơ sở của chế độ giáo đoàn mà ta có ngày nay
đã được thiết lập. Thế rồi từ đó họ tiến lên thành lập những thể chế và
cơ cấu hành chánh cho tổ chức giáo đoàn hiện tại.
Để thích ứng với thời mới, giáo đoàn dù đã có một tổ chức mới
rồi còn phải xúc tiến việc thống nhất giáo lý, nghi lễ, phương pháp tu
hành...những gì đến nay vẫn chưa thực hiện được. Đặc biệt đối với
một việc hình thành một đại giáo đoàn vào lớn bậc nhất như tông Tào
Động, đó là cả một việc làm to tát. Năm 1889, họ đã công bố Dôjô
Gyôji Kihan (Động Thượng Hành Sự Qui Phạm) để qui định việc xuất
gia, tu hành và những trách vụ, qua năm sau, qui chuẩn cho việc
truyền đạo của người tu tại gia với tên gọi là Sôtô Kyôkai Shushôgi
(Tào Động Giáo Hội Tu Chứng Nghĩa hay Tu Chứng Nghĩa) cũng đã
ra đời. Trong thời gian này, từ trong phái Tào Động đã nẩy sinh ra
những "tôn giáo mới" như Cứu Thế Giáo (Kuzekyô) của một người
tên là Daidô Chôan (Đại Đạo Trường An, 1843-1908) vốn dựa trên tín
ngưỡng Quan Âm, và Pháp Vương Giáo (Hôdôkyô) của Takada
Dôken (Cao Điền Đạo Kiến, 1858-1923) nhưng cũng có thể hiểu đó là
hiện tượng phải xảy ra trong quá trình tiêu chuẩn hóa một giáo đoàn.
Văn bản Động Thượng Hành Sự Qui Phạm đã có những qui định
như "phải ngừng các hình thức cúng tế kỳ quái" do đó việc đốt tiền
