Shinran mất đi, một miếu đường đã được xây dựng và con cháu của
ông thay nhau chăm sóc. Đó chính là chùa Hongan-ji. Tuy nhiên,
thế lực của chùa Hongan-ji ngay trong tông phái Tịnh Thổ Chân
tông cũng là rất nhỏ, mà những phái do các môn đệ của Shinran lập
nên như Takada (Cao Điền) hay Bukkō-ji (Phật Quang tự) mới có
sức mạnh lớn lao. Tuy nhiên, đến đời tổng trụ trì thứ 8 là Rennyo
(Liên Như, 1415-1499) thì Hongan-ji mới phát triển mạnh mẽ đến
không ngờ. Rennyo đã giáo hóa ở Oumi (Cận Giang), một vùng gần
kinh đô thời bấy giờ và giao chiến với thế lực của Hieizan vốn lo
sợ sự khuếch trương của Hongan-ji. Năm Bunmei (Văn Minh) thứ 3
(1471) Rennyo lui về vùng Yoshizaki (Cát Khi) ở Echizen (Việt
Tiền)
, nhưng ngay cả ở đó các môn đồ cũng dồn dập đổ về quy
y và trở thành vương quốc riêng của tông phái Tịnh Thổ Chân tông.
Từ đây đã sinh ra sự thù ghét của những thế lực chính trị và thế
lực tôn giáo vốn không mấy dễ chịu khi Tịnh Thổ Chân tông phát
triển một cách nhanh chóng như vậy. Cuối cùng, vào năm Bunmei
thứ 6, các môn đồ của phái Hongan-ji liên kết với Togashi
Masachika để chiến đấu với Quan thủ hộ
Togashi Kōchiyo
, người đã liên kết với các môn đồ của phái
Takada. Cuối cùng phái Hongan-ji đã giành chiến thắng. Tuy
nhiên, sau khi Masachika trở thành Quan thủ hộ thì họ lại mâu thuẫn
với ông ta. Năm sau Rennyo mất tại Yoshizaki và sang năm Bunmei
thứ 10 (1478), người ta đã khởi công xây dựng chùa Hongan-ji ở
Yamashina. Sau khi Rennyo mất, ở Kaga các môn đồ của Hongan-ji
ủ
ng hộ Togashi Masachika, nhưng cuối cùng vào năm Chōkyō
(Trường Hưởng) thứ 2 (1488), sự mâu thuẫn giữa hai bên càng trở
nên căng thẳng khiến phía Ikkō Ikki đã tấn công phái Masachika
và đã hạ gục. Đến lúc này, giấc mơ về một “vương quốc do những
môn đồ làm chủ” đã được thực hiện. Sau đó, phái Ikkō Ikki đã mở
rộng ra toàn quốc và thực thi việc chi phối hoàn toàn về tôn giáo
cho đến khi chùa Hongan-ji ở Ishiyama
bị Oda Nobunaga