trong hai lần vào năm Taishō thứ 9 (1920) và năm Shōwa thứ 10
(1935) vì tội bất kính. Đặc biệt cuộc đàn áp lần thứ hai được thực
hiện khá triệt để. Khoảng gần 1000 cán bộ của giáo đoàn bị bắt và
bản thân trụ sở chính bị phá sạch. Onisaburō thì bị quản thúc từ năm
Shōwa 17 (1942) và được cho là vô tội sau khi Nhật Bản bại chiến,
nhưng ông không thể phục hồi lại thế lực như những năm trước
được nữa. Cùng với Linh hữu hội, Đại Bản giáo đã hoàn thành vai trò
của mình trong khi các tôn giáo mới manh nha vào thời Shōwa để từ
đó xuất hiện những nhà lãnh đạo mới như Okada Shigeyoshi của
Sekai Kyūsei-kyō (Thế giới cứu thế giáo) hay Taniguchi Masaharu
của Seichō-no-ie (Tạm dịch là Ngôi nhà của sự sinh trưởng).